Евгений Сипягин является представителем в судебных процессах, в частности - представлял интересы своего брата Владимира Сипягина в судебном процессе по разделу совместно нажитого имущества после после развода с супругой Мариной Гулиной.

По информации телеканала РЕН ТВ, Евгений Сипягин в 1993 году привлекался в качестве обвиняемого по статье 93-1 УК РСФСР "Хищение государственного или общественного имущества в особо крупных размерах". От ареста Сипягин скрылся в Белоруссии, где в декабре 2005 года был осужден за подделку документов сроком на пять месяцев. 31 августа 2006 года Фрунзенский районный суд города Владимира признал Евгения Сипягина виновным по статье 159 части 2 УК РФ "Мошенничество при получении выплат, совершенное группой лиц по предварительному сговору", однако он был освобожден от наказания по амнистии. Владимир Сипягин признал криминальное прошлое своего брата.